TRAP-PCR银染法端粒酶活性检测试剂盒
凯基TRAP-PCR银染法端粒酶活性检测试剂盒
(TRAP-silver staining omerase Detection Kit )
Cat number:KGA412 For Research Use Only
Store at-20℃ for one year
Expire date:20101208

一、试剂盒说明
端粒酶是合成染色体末端的端粒的酶。端粒(omere)是真核生物染色体的天然末端,由上千个6碱基重复序列组成(TTAGGG)组成,是细胞必需的遗传组分,它的作用是维持端粒有足够的长度,保证基因信息在复制过程的准确性,以防止染色体末端遗传信息的丢失。在正常情况下,每个细胞分裂周期都会使端粒变得越来越短,当端粒短到一定程度就会发出信号,细胞停止分类。
端粒酶由RNA和蛋白质亚基组成,是基本的核蛋白逆转录酶,在细胞染色体复制过程中,能够以自身RNA为模板,在染色体3’末端合成重复序列,维持端粒的长度。正常人体细胞中不能检测出端粒酶活性的表达,而肿瘤细胞株及大多数肿瘤组织中的端粒酶活性却异常的高表达。因此对组织或细胞中端粒酶活性的检测具有重要意义。TRAP-银染法端粒酶活性检测试剂盒是采用端粒重复序列扩增的方法,利用银染技术检测端粒酶的活性。阳性结果在凝胶电泳上显示相隔6 bp的梯状条带,条带的深浅表示端粒酶活性的大小。TRAP-银染法保留了传统TRAP法灵敏度高、特异性强等优点,同时缩短了检测所需的时间,避免了同位素的放射污染。
本试剂盒适用于培养细胞及新鲜组织端粒酶活性检测,与通常的端粒酶活性测定法相比较,具有以下特征:
内标与端粒酶提取液在同一管中进行PCR扩增,提高了检测的准确性;
优化引物设计,是PCR效果进一步提高
二、试剂盒组份
组份 | KGA412 (20 assays) | KGA413 (50 assays) | KGA414 (100 assays) | 储存条件 |
Wash buffer | 20 mL | 50 mL | 100 mL | 40C |
Lysis buffer | 1.2mL | 3.0 mL | 5.0 mL | 40C |
10×TRAP buffer | 100μL | 250μL | 500μL | 40C |
dNTPs | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
Taq-DNA polymerase | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
TS primer | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
CX primer | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
内标引物 | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
20μL | 50μL | 100μL | -200C |
三、试剂盒以外自备仪器和试剂
高速冷冻离心机、涡旋振荡仪、PCR扩增仪、微量移液器、DEPC水处理并灭菌的枪头、离心管等
PBS、1M DTT、PMSF(100mM溶于异丙醇)、0.5Mβ-巯基乙醇、DEPC水
蛋白定量试剂及仪器(可选购凯基Bradford法或BCA蛋白浓度测定试剂盒)
聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染相关仪器及试剂(具体参见操作方法)
四、操作方法
建议使用经DEPC水处理并灭菌的枪头、离心管等实验器材
1. 细胞端粒酶或组织标本端粒酶的提取
1.1 用PBS洗涤细胞二次(离心2000rpm,5min)收集1~2×106细胞;若是组织标本,称取40-100mg左右的组织,用PBS洗涤后,研碎;
1.2 加入1ml冰冷的Wash buffer (使用前每ml Wash buffer中加入1μL 1M的DTT),悬浮上述样品,置冰上5min;
1.3 4oC,离心 (10,000 rpm,5min),弃上清;
1.4 加入40μL冰冷的Lysis buffer [使用前每ml Lysis buffer中加入2μLβ-巯基乙醇(0.5M溶于水,一般市售纯液体为14.3M)],悬浮沉淀,涡旋振荡10s,置冰上30min,其中间隔数分钟,涡旋振荡一次,共3~5次;
1.5 4oC,离心 (13,000 rpm,30min);
1.6 转移上清,分装3-4管,每管约20μL。其中一份样品进行蛋白质浓度测定,其余迅速冷冻,-70℃保存。
1.7 浓度测定后,根据结果zui后用Lysis buffer调浓度至1μg /μL,用于下一步实验。
2. PCR扩增
1.1 吸取2.5μL 10×TRAP buffer,另加入0.5μL dNTPs, 0.5μL TS primer,2μL端粒酶提取物,然后加入19.5μL ddH2O,于PCR扩增仪上23 oC保温30min;
注:蛋白上样范围较广,可从10ng~10μg,建议根据实际情况调整。
1.2 上述各管中加94℃加热1分钟灭活。
1.3 向上述各管中加入2.5μL 10×TRAP buffer,0.5μL dNTPs,0.5μL TS primer,1μL CX primer,0.5μL Taq-DNA polymerase,18μL ddH2O,混匀,于PCR扩增仪上进行扩增:
94 °C,3 min;
94 °C,30s;45°C,35s;72 °C,90s;5个循环;
72 °C,延伸60s。
1.4 在上述扩增结束时,暂停仪器运行,快速向各管中加入内标模板1μL,内标引物1μL。继续运行仪器,进行以下的扩增实验:
94 °C,60s;
94 °C,40s;60°C,35s;72 °C,50s;35-36个循环;
72 °C,延伸10min。
以下步骤的试剂需用户自备:
3. 聚丙烯酰胺凝胶电泳
3.1 制备10%非变性聚丙烯酰胺凝胶(20ml)
37%Acr-Bis(36:1) | 5.46 ml |
ddH2O | 12.4 ml |
10×TBE | 2 ml |
10%APS | 125μL |
TEMED | 15μL |
3.2 电压17.5V/cm,电泳Buffer:0.5×TBE,所制凝胶垂直电泳预跑1-2小时;
3.3 取9μL PCR产物加上1μL 10×上样缓冲液,在电压17.5V/cm,10%非变性聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳50~60min;
4. 银染
4.1 将凝胶置10%乙酸固定30min,然后用蒸馏水漂洗3次,每次5min;
4.2 将凝胶置于0.2 g/L*浸泡1min,然后用蒸馏水漂洗3次,每次30s;
4.3 将凝胶置于*染液浸泡30min,然后用蒸馏水漂洗15s;
4.4 将凝胶置于显色液中显色10min左右直到全部条带显色为止;
4.5 zui后将凝胶置于10%乙酸浸泡5min终止反应。
用户自备试剂配方:
*染液(100mL) 10×上样缓冲液(10mL)
0.2g * 25mg 溴酚兰
25μL 37%甲醛 4g 蔗糖
定容至100mL 定容至10mL
10×TBE(pH=8.3) (100mL) 显色液(100mL)
10.8g Tris 3g 碳酸钠
5.5g 硼酸 25μL 37%甲醛
4ml 0.5M EDTA 0.4mg *
定容至100mL 定容至100mL
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